CF

compsort for Mac

Kirjastaja: Paul A. Wilson
Mac Free
Lae alla v1.01 29 allalaadimisi
Versioon1.01
Kirjastaja Paul A. Wilson
Väljalaske kuupäev25. aug 2008
Kuupäev lisatud11. aug 2004
Os nõudedMacintosh, Mac OS X 10.3
NõudedMac OS X 10.3
Allalaadimisi kokku29
HindFree

Kirjeldus

Käsurea tööriist komadega eraldatud andmefailide võrdlemiseks, kasutades suhtelisi erinevusi kõige sarnasemate konformatsioonide määramiseks. Compsort võrdleb andmefaile suhtelise erinevuse abil, arvutab sarnasuse skoori, sorteerib hinded kasvavas järjekorras (madalamad väärtused tähistavad suuremat sarnasust), salvestab X arvu madalaid punkte.

Kasutaja loodud andmefailid peavad olema komadega eraldatud tekstifailid. Iga fail esindab ainulaadset molekuli. Iga rida failis tähistab molekuli ainulaadset konformatsiooni. Andmefaili esimene veerg peab olema silt, mis on ainulaadne rea esindatava konformatsiooni jaoks. Ülejäänud veerud on numbrilised deskriptorid, näiteks kauguse mõõtmised.

Ridasid võrreldakse failide vahel kombinatoorselt. Võrreldavad sildid ühendatakse ja salvestatakse ridade komplekti skooridega. See annab võimaluse tuvastada konformatsioonid, mis andsid antud sarnasuse skoori.

Edasine töö hõlmab:

GUI liidese lisamine

postitan oma 3D-farmakofoori modelleerimisalgoritmi

MPI-d kasutav paralleelversioon

Sarnased programmid

Alternatiivid

Rohkem sellest väljaandjast