Optogenetics for iOS

Kirjeldus

Optogeneetika on tööriist, mis aitab uurijal arvutada vajaliku optilise võimsuse antud in vivo eksperimendi jaoks, mis hõlmab optogeneetikat või mis tahes muud eksperimentaalset lähenemisviisi, mis hõlmab valguse edastamist sügavatesse ajupiirkondadesse optiliste kiudude kaudu. Erinevatel ajupiirkondadel on erinevad optilised omadused, mis määravad, kuidas valgus valguskiust väljumisel hajub ja jaotub. Antud katseprojekti jaoks vajaliku valguse hulga hindamiseks on vaja teadmisi valitud ajupiirkonna spetsiifiliste hajumise omaduste, kasutatava spetsiifilise opsiini ja optilise kiu omaduste kohta. Kui kasutaja sisestab need parameetrid rakendusse APP, arvutab see maksimaalse sügavuse, mille juures võib oodata opsiini ergastamist. Läbitungimissügavus joonistatakse optilise võimsuse (mW) funktsioonina, nii et kasutaja saab näha, kuidas valgus konkreetsetel asjaoludel ajukoes hajub. Versioon 2 toetab 17 erinevat opsiini ja täielikku valguse hajumise ajuatlast täiskasvanud hiire jaoks, mis võimaldab kasutajal otsida enda valitud ajupiirkonda ja lugeda selle konkreetse piirkonna spetsiifilist hajumise koefitsienti. Selle teaduslikuks aluseks kalkulaatorit, vt Al-Juboori, Dondzillo, Stubblefield, Felsen, Lei ja Klug: Valguse hajumise omadused erinevad täiskasvanud hiire aju erinevates piirkondades. PlosONE, trükis.Kasutusjuhendi ja lisateabe saamiseks vaadake www.optogeneticsapp.com. Saadaval on Pro ja Lite versioon. Need kaks versiooni on identsed, välja arvatud see, et Pro versioon sisaldab täielikku ajuatlast, mis koosneb 43 pildist/plaadist, samas kui atlas Lite versioonil on ainult 5 plaati.