GenoSuite
| Versioon | 2.0.1 |
|---|---|
| Kirjastaja | Dhirendra Kumar |
| Väljalaske kuupäev | 2. mai 2013 |
| Kuupäev lisatud | 2. mai 2013 |
| Os nõuded | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Nõuded | None |
| Allalaadimisi kokku | 22 |
| Hind | Free |
Kirjeldus
GenoSuite on proteogenoomilise analüüsi jaoks välja töötatud raamistik. FDRScore-põhist strateegiat kasutatakse mitme otsingualgoritmi tulemuste integreerimiseks. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) on välja töötatud GenoSuite raamistiku osana. PPT on mõeldud uute translatsioonide leidmiseks prokarüootsetes genoomides ja see sõltub massispektromeetriapõhistest proteoomikaandmetest ja sellega seotud genoomi järjestusest. Funktsioonid on konfigureeritud neljale avatud lähtekoodiga algoritmile, et otsida andmebaasist peptiidide identifitseerimist, ja valida saab 4 algoritmi mis tahes kombinatsiooni, loetleb genoomiotsingu spetsiifilised peptiidid (uudsed peptiidid), spektraalseid vasteid saab visualiseerida kvaliteedi hindamiseks, loetleb välja. Samuti saab luua uudseid valke ja olemasolevate valgu annotatsioonide muutusi ning uute peptiidide visuaalset genoomset konteksti.
