MultiGeneBlast
| Versioon | 1.1.5 |
|---|---|
| Kirjastaja | MultiGeneBlast |
| Väljalaske kuupäev | 3. apr 2013 |
| Kuupäev lisatud | 4. apr 2013 |
| Os nõuded | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Nõuded | None |
| Allalaadimisi kokku | 95 |
| Hind | Free |
Kirjeldus
MultiGeneBlast on avatud lähtekoodiga tööriist, mis põhineb NCBI GenBanki valgukirjete FASTA päiste ümbervormindamisel, mille abil saab leida nende lähtenukleotiidi ja koordinaate. MultiGeneBlast võib aidata sünteetilise bioloogia projektide jaoks selliste mitmegeeniliste osade tuvastamisel. Selle väljundi põhjal saab luua sünteetilise operonite teegi, et tuvastada need operonid, mille funktsioon on kasutaja soovitud funktsioonile kõige lähemal. See tööriist annab võimaluse tuvastada kõik homoloogsed genoomsed piirkonnad, kombineerides iga geeni üksikute BlastP-käibete tulemusi ja sorteerides genoomsed piirkonnad mis tahes GenBanki kirjest tabamuste arvu, sünteesi säilitamise ja kumulatiivse Blast-biti skoori järgi. Arhitektuuriotsingut saab teha mis tahes genoomse piirkonna leidmiseks, millel on Blast-tabamused mis tahes kasutaja määratud aminohappejärjestuste kombinatsioonile.
